Фонд был основан в 1999 году. Сегодня это крупнейшая благотворительная организация Липецкой области, которая входит в Топ-10 рейтинга RAEX корпоративных и частных благотворительных НКО в России. Фонд входит в Ассоциацию грантодающих организаций «Форум Доноров».
Фонд «Милосердие» помогает в организации общественно значимых мероприятий в сферах науки и образования, культуры и спорта, участвует в благотворительных акциях, финансирует социально значимые проекты, поддерживает волонтерские движения и общественные инициативы. С начала деятельности оказана помощь на сумму около 7 млрд рублей. Ежегодно ее получают более 30 тыс. человек.
Успехи фонда в сфере благотворительности отмечались почетной грамотой Торгово-промышленной палаты России, дважды — золотым знаком «За заслуги перед Липецком» и трижды — высшими наградами всероссийского конкурса добровольных публичных годовых отчетов «Точка отсчета». Грантовая программа «Стальное дерево», которая реализуется при поддержке фонда, стала победителем всероссийского конкурса «Лучшие социальные проекты России».