В Московском марафоне участвовали «благобегуны» фонда «Волонтеры в помощь детям-сиротам». В течение года они участвуют в массовых забегах в разных городах России и собирают средства для детей с особенностями развития и тяжелыми заболеваниями. На старт Московского марафона вышли более 40 сторонников фонда. 6 человек бежали в поддержку фонда 42,2 км, остальные 10. Каждый бегун до марафона рассказывал в соцсетях о подопечном фонда и собирал пожертвования. К 20 сентября в итоге было собрано более 470 тыс. рублей на медицинскую помощь и лекарства детям.
Благотворительный фонд «Семьи СМА» объявил акцию #бежимзадвоих. Ее участники представляли на марафоне детей и взрослых со спинальной мышечной атрофией, которые не могут бежать сами, но тоже мечтают почувствовать ветер в волосах, услышать ободряющее «Давай!», сделать рывок и пересечь финишную линию. В акции #бежимзадвоих участвовали 54 пациента и более 500 бегунов. Цель акции – привлечь внимание к проблемам людей со СМА и собрать средства для проекта «Клиника СМА».
В Московском марафоне участвовала также команда фонда «Жизнь в движении». Она собирала средства на протезирование для спортсменки Саши Гладковой, которая потеряла ногу из-за несчастного случая, и на развитие благотворительной программы «Хочу ходить».
Фонд «Линия жизни» вел сбор средств для оплаты медицинских инструментов, оборудования и операций. Служба помощи «Милосердие» провела акцию «Милосердие на бегу» и собрала 1,8 млн рублей для своих подопечных. В Московском марафоне также приняли участие благотворительные фонды «Движение вверх», «Спорт для жизни» и «Огромное сердце».
Благотворительные сборы всегда проводятся при подготовке марафонов «Большой шестерки». Попасть на марафон в Бостон, Лондон, Берлин, Чикаго, Нью-Йорк или Токио для бегуна — как покорить Эверест для альпиниста. Выступление от имени благотворительного фонда — один из самых надежных способов исполнить свою мечту для бегунов, которые не относятся к спортивной элите. «Самым благотворительным» из марафонов-мейджоров считается Лондонский. К марафону 2020 года свои команды бегунов набрали более 60 благотворительных организаций. 4 октября состоится забег с ограниченным числом участников на закрытой трассе в центре Лондона. И в этот же день в 81 стране свою марафонскую дистанцию самостоятельно пробегут участники «виртуального марафона». Ожидается, что это будет самое большое виртуальное спортивное мероприятие в истории. За предыдущие марафоны в Лондоне на благотворительные цели было собрано более миллиарда фунтов стерлингов.